Peter Böckli studierte Rechtswissenschaft an der Universität Basel, wo er 1960 mit einer Arbeit zum Aktienrecht promoviert wurde. Er lehrte bis zu seiner Emeritierung 2001 als ausserordentlicher Professor mit Lehraufträgen für Steuerrecht und Wirtschaftsrecht an der Juristischen Fakultät der Universität Basel. Daneben hatte er Mandate als Verwaltungsrat von Schweizer Publikumsgesellschaften. Vom Schweizer Bundesrat wurde er in Expertenkommissionen zur Vorbereitung der Revision von Bundesgesetzen berufen. Als Mitglied des Verwaltungsrates von Nestlé war er von 1995 bis 2003 Mitglied der Stiftungsrates des Fondation Nestlé pour l’Art.